Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3aO70157 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3aO70157 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3aO70157 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3aO70157 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Top3aO70157 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top3aO70157 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top3aO70157 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3aO70157 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms