Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb5O55234 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb5O55234 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms