Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChkbO55229 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChkbO55229 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ChkbO55229 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChkbO55229 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChkbO55229 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChkbO55229 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChkbO55229 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChkbO55229 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms