Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rpl35aO55142 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpl35aO55142 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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