Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bnip3O55003 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bnip3O55003 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bnip3O55003 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bnip3O55003 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bnip3O55003 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bnip3O55003 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bnip3O55003 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bnip3O55003 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bnip3O55003 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bnip3O55003 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bnip3O55003 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms