Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NlkO54949 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NlkO54949 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NlkO54949 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NlkO54949 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NlkO54949 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NlkO54949 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NlkO54949 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NlkO54949 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NlkO54949 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NlkO54949 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NlkO54949 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NlkO54949 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NlkO54949 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NlkO54949 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NlkO54949 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NlkO54949 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NlkO54949 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NlkO54949 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NlkO54949 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NlkO54949 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NlkO54949 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NlkO54949 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NlkO54949 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NlkO54949 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NlkO54949 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NlkO54949 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NlkO54949 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NlkO54949 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NlkO54949 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NlkO54949 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NlkO54949 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NlkO54949 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NlkO54949 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NlkO54949 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NlkO54949 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NlkO54949 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NlkO54949 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NlkO54949 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NlkO54949 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NlkO54949 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NlkO54949 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NlkO54949 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NlkO54949 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NlkO54949 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NlkO54949 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NlkO54949 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NlkO54949 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NlkO54949 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NlkO54949 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NlkO54949 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NlkO54949 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NlkO54949 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NlkO54949 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NlkO54949 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NlkO54949 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NlkO54949 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NlkO54949 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NlkO54949 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NlkO54949 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NlkO54949 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NlkO54949 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NlkO54949 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NlkO54949 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NlkO54949 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NlkO54949 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms