Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarce1O54941 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smarce1O54941 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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