Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Socs5O54928 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Socs5O54928 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Socs5O54928 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Socs5O54928 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Socs5O54928 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Socs5O54928 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Socs5O54928 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms