Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dkk1O54908 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk1O54908 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms