Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms