Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffbO54788 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffbO54788 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffbO54788 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffbO54788 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffbO54788 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffbO54788 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffbO54788 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffbO54788 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffbO54788 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffbO54788 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffbO54788 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffbO54788 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffbO54788 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffbO54788 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffbO54788 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffbO54788 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffbO54788 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffbO54788 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffbO54788 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffbO54788 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffbO54788 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffbO54788 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffbO54788 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffbO54788 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffbO54788 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffbO54788 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DffbO54788 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DffbO54788 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffbO54788 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffbO54788 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffbO54788 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffbO54788 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffbO54788 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffbO54788 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffbO54788 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffbO54788 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffbO54788 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffbO54788 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffbO54788 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffbO54788 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffbO54788 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DffbO54788 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffbO54788 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffbO54788 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffbO54788 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffbO54788 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffbO54788 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffbO54788 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffbO54788 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffbO54788 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffbO54788 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffbO54788 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DffbO54788 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffbO54788 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffbO54788 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffbO54788 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffbO54788 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffbO54788 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffbO54788 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffbO54788 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffbO54788 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffbO54788 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DffbO54788 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DffbO54788 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms