Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf9O35739 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf9O35739 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf9O35739 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf9O35739 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf9O35739 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf9O35739 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf9O35739 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf9O35739 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf9O35739 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf9O35739 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf9O35739 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf9O35739 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf9O35739 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms