Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stx1aO35526 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx1aO35526 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms