Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc27a2O35488 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc27a2O35488 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms