Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccrl2O35457 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccrl2O35457 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms