Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn1O35350 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn1O35350 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms