Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kpna3O35344 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna3O35344 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms