Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hs3st1O35310 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st1O35310 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms