Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Polr1aO35134 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr1aO35134 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Polr1aO35134 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms