Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scarb2O35114 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Scarb2O35114 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Scarb2O35114 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scarb2O35114 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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