Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn4O35054 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn4O35054 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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