Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sypl1O09117 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sypl1O09117 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms