Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hps1O08983 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hps1O08983 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hps1O08983 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hps1O08983 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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