Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Eftud2O08810 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Eftud2O08810 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms