Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn1O08788 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms