Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltaO08585 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltaO08585 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltaO08585 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CltaO08585 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltaO08585 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltaO08585 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltaO08585 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltaO08585 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltaO08585 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltaO08585 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltaO08585 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltaO08585 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltaO08585 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltaO08585 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltaO08585 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltaO08585 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltaO08585 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltaO08585 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltaO08585 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltaO08585 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltaO08585 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltaO08585 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltaO08585 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CltaO08585 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltaO08585 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltaO08585 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltaO08585 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CltaO08585 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CltaO08585 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltaO08585 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltaO08585 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltaO08585 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltaO08585 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltaO08585 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltaO08585 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltaO08585 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltaO08585 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltaO08585 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CltaO08585 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CltaO08585 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltaO08585 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltaO08585 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltaO08585 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltaO08585 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltaO08585 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltaO08585 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CltaO08585 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltaO08585 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltaO08585 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltaO08585 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltaO08585 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltaO08585 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltaO08585 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltaO08585 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltaO08585 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltaO08585 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CltaO08585 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltaO08585 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltaO08585 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltaO08585 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltaO08585 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltaO08585 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CltaO08585 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltaO08585 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltaO08585 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltaO08585 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltaO08585 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltaO08585 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CltaO08585 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltaO08585 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CltaO08585 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltaO08585 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltaO08585 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltaO08585 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltaO08585 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltaO08585 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltaO08585 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CltaO08585 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltaO08585 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltaO08585 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltaO08585 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltaO08585 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltaO08585 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltaO08585 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms