Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
U90926O08546 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
U90926O08546 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
U90926O08546 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
U90926O08546 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
U90926O08546 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
U90926O08546 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
U90926O08546 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
U90926O08546 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
U90926O08546 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms