Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3278L7N2D2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm3278L7N2D2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3278L7N2D2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms