Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20878L7N244 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20878L7N244 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms