Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm5458L7N219 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm5458L7N219 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm5458L7N219 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm5458L7N219 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5458L7N219 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm5458L7N219 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm5458L7N219 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm5458L7N219 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm5458L7N219 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm5458L7N219 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm5458L7N219 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm5458L7N219 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5458L7N219 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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