Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34c2J3QNM1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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