Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm20834J3QM72 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20834J3QM72 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm20834J3QM72 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm20834J3QM72 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm20834J3QM72 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm20834J3QM72 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm20834J3QM72 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm20834J3QM72 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm20834J3QM72 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20834J3QM72 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms