Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pabpc4lG5E8X2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pabpc4lG5E8X2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms