Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tubgcp6G5E8P0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubgcp6G5E8P0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms