Protein–RNA interactions for Protein: G5E8K1

2610028H24Rik, RIKEN cDNA 2610028H24, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610028H24RikG5E8K1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610028H24RikG5E8K1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610028H24RikG5E8K1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms