Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip12G5E870 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip12G5E870 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms