Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pcf11G3X9Z4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcf11G3X9Z4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcf11G3X9Z4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms