Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hmgxb3G3X9M3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hmgxb3G3X9M3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hmgxb3G3X9M3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms