Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nccrp1G3X9C2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nccrp1G3X9C2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms