Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc9a3G3X939 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc9a3G3X939 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms