Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34aG3UW52 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn34aG3UW52 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn34aG3UW52 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34aG3UW52 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34aG3UW52 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34aG3UW52 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34aG3UW52 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34aG3UW52 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34aG3UW52 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34aG3UW52 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34aG3UW52 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34aG3UW52 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34aG3UW52 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34aG3UW52 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34aG3UW52 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms