Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srp72F8VQC1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srp72F8VQC1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms