Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
5830473C10RikF8VQ07 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5830473C10RikF8VQ07 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms