Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ercc6F8VPZ5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ercc6F8VPZ5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ercc6F8VPZ5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms