Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp9yF8VPU6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp9yF8VPU6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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