Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Farp1F8VPU2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Farp1F8VPU2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms