Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Arid4aF8VPQ2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Arid4aF8VPQ2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms