Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M1F7CXU4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms