Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gm28038F7BCN9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gm28038F7BCN9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gm28038F7BCN9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gm28038F7BCN9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm28038F7BCN9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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