Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5624F6ZZG8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5624F6ZZG8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5624F6ZZG8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5624F6ZZG8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5624F6ZZG8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5624F6ZZG8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5624F6ZZG8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5624F6ZZG8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms